Сергей Шаргунов родился 12 мая 1980 года в Москве. Его отец - Александр Шаргунов - социально активный православный священник. Ныне протоиерей, в 1994 году он создал общественный комитет "За нравственное возрождение Отечества" и стал в нем председателем. Отец Александр регулярно публикуется в газете "Завтра". Также Шаргунов-старший издал несколько книг собственного сочинения, такие как "Новые мученики России и чистота православия", "О значении канонизации царственных мучеников", а также "Последнее оружие".